Per lanciare un comando remoto basta passarlo come ultimo parametro al comando ssh.
Supponiamo ad esempio di volere la lista dei file della home page di "mioutente" su "mioserver"
ssh mioutente@mioserver ls -alh
Per fare, invece, il backup di tutta la home con il comando tar e salvare tutto in locale tramite comando ssh, lanciamo
ssh mioutente@mioserver tar czvf - . >miobackup.tgz